15 марта 1957 года руководством УВД Оренбургской области на западной окраине Новотроицка в районе Аккермановского рудоуправления решено было основать исправительно-трудовое учреждение ИТК-3.
В 1990 году по инициативе начальника колонии Александра Петровича Тарнавского произошло объединение учреждений ЮК-25/3, 5, 11.
В настоящее время в свете проводимых реформ в уголовно-исполнительной системе в учреждении проведена реконструкция помещения отрядов №1, 2 в помещения камерного типа вместимостью на 144 осужденных. Также выполнялись текущие ремонты на объектах производственно-хозяйственной деятельности, жилой зоны, колонии-поселения. С целью улучшения качества несения службы, обеспечения контроля за осужденными в ИК-3 проводится реконструкция инженерных сооружений, модернизация технических средств охраны.
За последнее время введены в эксплуатацию мельница, свинарник, линия по производству пеноблоков, пилорама. В промзоне учреждения смонтировано оборудование газовой котельной. Установленные современные цифровые системы учета расхода газа и тепловой энергии позволяют в режиме реального времени контролировать и регулировать расход энергоресурсов для соблюдения необходимого режима работы тепловой сети, не допуская при этом перерасхода тепла и газа.
Проведена работа по реконструкции кафе «Тройка» с установкой новейшего оборудования и современного стиля оформления, в результате чего площадь зала увеличилась на 59,5 квадратных метров и составила 143 квадратных метра, что сегодня позволяет обеспечивать горячим питанием не только сотрудников учреждения, но и гражданское население.
В рамках мероприятий социальной защиты личного состава завершено строительство пятиэтажного 40-квартирного жилого дома для сотрудников объединения исправительных учреждений.
Колония тратит немало сил для развития внебюджетной деятельности. Так, поголовье кур сегодня составляет около 2000 голов, утят – свыше 3000 голов. Кроме этого, в учреждении содержатся КРС, свиньи, кролики.
В рамках концепции продолжается работа по трудоустройству осужденных, имеющих иски и не погашающих их.
В колонии функционирует профессиональное училище, в котором организовано обучение по востребованным рабочим специальностям. Обучение осуществляется по 14 профессиям с выдачей диплома государственного образца. В настоящее время прошло обучение и получило профессиональное образование около 300 осужденных. Также проводится обучение осужденных, не имеющих полного образования. В ИК-3 имеется кабельное телевидение, которое дает широкие возможности для организации эффективного воспитательного процесса.